Dana 16. rujna 1993. u Genevi Momčilo Krajišnik i Alija Izetbegović potpisali su Srpsko-muslimansku deklaraciju, koja je praktički bila model raspada BiH: nakon referenduma srpski entitet mogao bi napustiti BiH i pripojiti se Srbiji, dok bi muslimansko-bošnjački entitet naslijedio mjesto BiH u UN-u i drugim međunarodnim organizacijama. To je do tad bila prva službena potvrda o promjeni granica. Drugi put je Alija pokušao podijeliti BiH kad je Tuđmanu 10. siječnja 1994. ponudio da Hrvatskoj pripoji Zapadnu Hercegovinu, a da ostale hrvatske krajeve prepusti Bošnjacima.